Temperatuur
Bioloogilistes nitrifikatsioonisüsteemides on nitrifitseerivad bakterid temperatuurimuutuste suhtes väga tundlikud. Vahemikus 5–35 kraadi suudavad nad läbi viia normaalseid füsioloogilisi metaboolseid tegevusi. Kui reovee temperatuur on alla 15 kraadi, väheneb nitrifikatsiooni kiirus oluliselt. Kui temperatuur on alla 10 kraadi, suudab juba käivitatud nitrifikatsioonisüsteem vaevalt oma tööd säilitada, nitrifikatsioonimäär on vaid 25% 30 kraadisest. Kuigi kõrgem temperatuur suurendab bioloogilist aktiivsust ja nitrifikatsioonikiirust, põhjustab liiga kõrge temperatuur suure hulga nitrifitseerivate bakterite surma. Tegelikus töös peaks nitrifikatsioonireaktsiooni temperatuur olema alla 38 kraadi. Seetõttu tuleks kõrge-ammoniaagisisaldusega reoveeprojektide kasutuselevõtt ideaaljuhul planeerida aastaaegadele, mil õhutemperatuur on üle 15 kraadi. Kui talvel on vaja käivitada, tuleks kasutada{16}}kõrge ammoniaagisisaldusega reoveepuhastite või isolatsiooni- ja küttesüsteemidega süsteemide pingeid.
pH väärtus
Nitrifitseerivad bakterid on pH muutuste suhtes väga tundlikud. Optimaalne pH väärtus on 8,0–8,4. Nendes optimaalsetes pH tingimustes võib nitrifikatsioonikiirus ja nitrifitseerivate bakterite maksimaalne suhe saavutada oma maksimumväärtused. Nitrifitseerivate bakterite kasvatamise ajal on ideaalne kõrge pH, umbes 8,0. Siiski ei tohiks selle poole üle pingutada; piisab süsteemi pH hoidmisest üle 6,5. Kui see langeb allapoole seda taset, tuleb viivitamatult lisada leeliselisus, näiteks seebikivi või sooda.
Lahustatud hapnik
Hapnik on nitrifikatsiooniprotsessis elektronide aktseptor. Lahustunud hapniku tase reaktoris mõjutab otseselt nitrifikatsiooniprotsessi. Aktiivmudasüsteemides usub enamik teadlasi, et lahustunud hapniku taset tuleks kontrollida vahemikus 1,5–2,0 mg/l; alla 0,5 mg/l, kipub nitrifikatsioon lakkama. Praegu usuvad paljud teadlased, et SND (Special Noise Discharge) võib tekkida madala DO (1,5 mg/L) juures. Kui DO > 2,0 mg/L, võib lahustunud hapniku kontsentratsiooni mõju nitrifikatsiooniprotsessile tähelepanuta jätta. Siiski ei tohiks DO kontsentratsioon olla liiga kõrge, kuna liigne lahustunud hapnik võib põhjustada orgaanilise aine liiga kiiret lagunemist, mille tagajärjeks on mikroorganismide toitainete defitsiit, aktiivmuda kerge vananemine ja lahtine struktuur. Lisaks põhjustab liiga suur lahustunud hapnik liigset energiatarbimist, mis on majanduslikult ebasoovitav.
Muda vanus
Nitrifitseerivate bakterite ellujäämise tagamiseks pideva vooluga reaktorisüsteemis peab mikroorganismide viibimisaeg (θc)N reaktoris olema suurem kui autotroofsete nitrifitseerivate bakterite minimaalne genereerimisaeg (θc) minN. Vastasel juhul ületab nitrifitseerivate bakterite kadumise määr netokasvu, mis viib nende täieliku väljasuremiseni süsteemist. Üldiselt peaks (θc)N väärtus olema vähemalt kaks korda suurem kui nitrifitseerivate bakterite minimaalne tekkeaeg, st ohutustegur peaks olema suurem kui 2.
Raskmetallid ja toksilised ained
Lisaks raskmetallidele on nitrifikatsiooni pärssivad ained: kõrge ammoniaaklämmastiku kontsentratsioon, nitraadi orgaanilise aine kõrge kontsentratsioon ja komplekssed katioonid.
BOD
Kui BHT süsteemis on kõrge, konkureerivad heterotroofsed bakterid lahustunud hapniku pärast nitrifitseerivate bakteritega. Kuna heterotroofsete bakterite arv on palju suurem kui nitrifitseerivate bakterite oma, ei saa nitrifitseerivad bakterid sageli piisavalt lahustunud hapnikku ega saa seetõttu kasvada ega paljuneda kõrge BHT tingimustes. Üldiselt inhibeerib üle 20 mg/l BHT nitrifitseerivaid baktereid. Kui sissevoolu KHT või süsinik{4}}lämmastikusisaldus on liiga kõrge, tuleb nitrifitseerivaid baktereid kasvatada pikema õhutamise teel. See tähendab õhutamise jätkamist isegi siis, kui süsteemi COD on juba vastuvõetavates piirides või madalal tasemel, võimaldades nitrifitseerivatel bakteritel piisavalt kasvuaega. Aereerimise ajal tuleb ka lahustunud hapnikku hoolikalt kontrollida, ideaaljuhul alla 3 mg/L, et vältida muda kiirendatud vananemist.
Ammoniaagi lämmastiku kontsentratsioon
Nitrifitseerivad bakterid inhibeeritakse, kui süsteemi ammoniaaklämmastiku kontsentratsioon jõuab 200 mg/l. Seetõttu on soovitatav, et süsteemi ammoniaaklämmastiku kontsentratsioon ei ületaks 150 mg/l. Suure -ammoniaagiga reoveepuhastuse korral võib ammoniaaklämmastiku kõrge kontsentratsiooni tõttu, kui seda hoolikalt ei jälgita, tõusta teatud tasemeni mitme tsükli jooksul, ületades sageli 200 mg/l mahutis A. Seetõttu peavad nitrifitseerivate bakterite kasvatamise ja normaalse töö ajal tagama süsteemi kontsentratsiooninõuded, et ammoniaaklämmastiku kontsentratsioon oleks alati ammoniaagiprotsessi piires. süsteem toodab kvalifitseeritud vett kasutuselevõtu algusest peale.